La Protezione Civile è la struttura comunale che si attiva tempestivamente all'insorgere di un evento rilevante che colpisca il territorio comunale. Essa è operativa attraverso le Associazioni di Protezione Civile, ciascuna specializzata per le diverse esigenze, che vengono attivate di volta in volta e inviate sul territorio secondo le direttive del Piano di Emergenza Comunale. Le attività di previsione e prevenzione sono tese a limitare i possibili danni derivanti dai rischi insiti nel territorio (terremoti, inondazioni, frane, inquinamento acque, incidenti industriali/ferroviari, ecc.) attraverso la comunicazione alla popolazione degli indicatori di pericolo/disagio (ondate di calore, rischio idrogeologico, rischio precipitazioni eccezionali, ecc.) e la tenuta in efficienza di mezzi e attrezzature per interventi tempestivi in caso di calamità. Il Comune di Muggiò per garantire nell'ambito del territorio comunale i servizi di propria competenza (Previsione, Prevenzione e Soccorso in occasione di Calamità) e la promozione del volontariato di Protezione Civile, si avvale dell’apporto dell’Associazione Volontari Protezione Civile A. Mussi e G. Arosio ONLUS di Lissone per le attività complementari di Protezione Civile così come previsto dalla vigente legislazione.